বিসিএস প্রশাসন একাডেমিতে স্বল্প পরিসরে চিকিৎসা সেবা প্রদানের জন্য একটি মেডিকেল সেন্টার রয়েছে। একাডেমিতে নিয়েজিত সকল কর্মকর্তা/কর্মচারী এবং প্রশিক্ষণার্থীগণ এ স্বাস্থ্য কেন্দ্র থেকে প্রাথমিক এবং জরুরী স্বাস্থ্যসেবা পেয়ে থাকেন। একজন অভিজ্ঞতাসম্পন্ন সরকারি ডাক্তার এবং একজন ফার্মাসিস্ট এ মেডিকেল সেন্টারে সার্বক্ষণিক স্বাস্থ্য সেবায় নিয়োজিত রয়েছেন। এছাড়া, এ সেন্টারের মাধ্যমে জরুরি প্রয়োজনে ঢাকাস্থ যেকোন হাসপাতালে ভর্তির ব্যাপারে সহযোগিতা প্রদান করা হয়। মেডিকেল সেন্টারের মাধ্যমে প্রশিক্ষণার্থীদের শিশুদেরও জরুরী চিকিৎসা প্রদান করা হয়। এ মেডিকেল কেন্দ্রকে সম্প্রসারণের জন্য একটি প্রকল্প গ্রহণ করা হচ্ছে।